Mikrobiološki laboratorij bi moral biti postavljen kot neodvisno območje, ločeno od drugih laboratorijev, z nadzorom dostopa na vratih, osebje brez povezave pa ne sme vstopati. Vsaka soba je primerno razporejena glede na delovno vsebino, ki je priročna za delo in ne vplivata drug na drugega. Vhod je opremljen s centraliziranim premikom, prostor za kulturo pa je mogoče postaviti v skladu z različnimi pogoji in vrstami kulture (kot so soba za gojenje plesni, soba za gojenje bakterij, soba s trdno kulturo, soba s tekočimi kulturami itd.).

Nato za funkcionalni oddelek mikrobiološkega laboratorija:
(1) Pripravljalna soba - soba za pripravo se uporablja za pripravo gojišč in obdelave vzorcev itd.
Obstajajo omare z reagenti, pulti za shranjevanje pripomočkov ali materialov, napajalniki, električne peči, hladilniki, laboratorijske klopi ter voda in kanalizacija.
(2) Pralnica - pralnica se uporablja za pomivanje posode itd.
Ker so bili uporabljeni pripomočki onesnaženi z mikroorganizmi, včasih še vedno obstajajo patogeni mikroorganizmi. Zato je, ko pogoji to dopuščajo, najbolje postaviti pralnico. V zaprtih prostorih naj bodo opremljeni z grelci, parnimi lonci, umivalniki in sodi za pomivanje posode ter različnimi ščetkami za steklenice, dekontaminacijskim prahom, pralnim praškom, milom itd.
(3) Prostor za sterilizacijo - prostor za sterilizacijo se uporablja predvsem za sterilizacijo gojišč in sterilizacijo različnih pripomočkov
Prostor naj bo opremljen s parnim sterilizatorjem, pečico in drugimi napravami za sterilizacijo.
(štiri) sterilna soba - poseben laboratorij za aseptične operacije, kot so sistematična inokulacija in čiščenje bakterij
(1) Sterilna soba se imenuje tudi soba za inokulacijo. Na splošno je to samostojna majhna soba (izolirana od zunanje sobe) z višino 4 ~ 5 m2 in višino 2,5 m, ki je posebej postavljena v mikrobiološkem laboratoriju.
(2) V zraku splošnega okolja zaradi prisotnosti veliko prahu in bakterij zlahka povzročimo onesnaževanje in močno oviramo delo pri cepljenju.
(3) Pri mikrobiološkem delu je inokulacija in presaditev bakterijskih vrst glavna operacija. Značilnost te operacije je zagotavljanje čistih bakterijskih vrst in preprečevanje kontaminacije z različnimi bakterijami.
Načrt gradnje mikrobiološkega varnostnega laboratorija vključuje: postavitev in okrasitev stavb, klimatsko napravo, vodovod in odtok, oskrbo s plinom, električno načrtovanje, centralizirano krmiljenje, varnost, gradbeno tehnologijo, testiranje, usposabljanje in druge vidike. Če želite zgraditi tovrstni laboratorij, morate poiskati tudi profesionalno podjetje za projektiranje in gradnjo laboratorijev. BOKA laboratorijska tehnologija je podjetje, ki izpolnjuje zahteve in ima v celoti izkušnje pri zagotavljanju celovitih rešitev za mikrobiološke laboratorije.