Biološka varnostna omara razreda III zagotavlja absolutna varnostna zagotovila, da varnostne omare razreda I in II ne morejo zagotoviti. Vse biološke varnostne omare razreda 3 so popolnoma zaprti. Poskus je bil izveden v celoti skozi čelne rokavice. Med dnevnim delovanjem notranjost ohišja vedno vzdržuje negativen tlak. Tudi v primeru okvare sistemskega preprečevanja onesnaževanja lahko to.
Vse biološke varnostne omare razreda 3 so zaščitene s čistim zrakom, filtriranim s filtrom HEPA, in preprečiti navzkrižno kontaminacijo vzorcev. Izpušni plin običajno filtriramo skozi HEPA. Ali uporabite dva HEPA filtra ob strani. Postavke, potrebne za preizkus, so bile vstavljene v omarico skupaj z izolacijskim kanalom, nameščenim na strani ohišja. Varnostne omare stopnje 3 običajno usmerjajo izpušni plin v laboratorij. Vendar pa se zrak lahko odvaja tudi neposredno v zunanje okolje z zunanjo izpušno cevjo. Pri uporabi izpušnih cevi je tridimenzionalna varnostna omara primerna tudi za mikrobiološke postopke, ki zahtevajo dodajanje strupenih kemikalij med preskusom. Vse biološke varnostne omare razreda 3 se lahko uporabljajo pri poskusih mikrobiološkega dejavnika, ki vključujejo ravni biološke varnosti na ravni ena, dva, tri in štiri.